一种导致美国南部棉花作物受损的病毒在美国田野中潜伏了近20年——未被发现。根据新研究，棉花叶卷矮病毒（CLRDV）长期以来被认为是最近抵达的病毒，早在2006年就已经感染了棉花种植州的植物。
一种导致美国南部棉花作物受损的病毒在美国田野中潜伏了近20年——未被发现。根据新研究，棉花叶卷矮病毒（CLRDV）长期以来被认为是最近抵达的病毒，早在2006年就已经感染了棉花种植州的植物。
该研究的发现发表在《植物病害》杂志上，由美国农业部农业研究服务局的研究人员和康奈尔大学的合作者完成，挑战了关于该病毒何时及如何出现在美国棉花中的长期假设。研究还展示了现代数据挖掘工具如何在病毒尚未被提及之前便能发现隐藏的威胁。
“CLRDV在2017年被正式检测到，因此假设它仅在最近才进入美国，” 奥莱汉德罗·奥尔梅多-维拉尔德（Alejandro Olmedo-Velarde）说，他曾是康奈尔大学的博士后研究员，现在是爱荷华州立大学植物病理学、昆虫学和微生物学系的助理教授。“我们的研究表明，这种病毒实际上在该国的棉花带早于那时就已存在。我们在2016年密西西比州的样本、2015年路易斯安那州的样本，以及2018年加利福尼亚州的样本中发现了病毒的明确证据。”
为了确认这些发现，研究团队在2023年进行了田野调查，收集了南加州的新鲜棉花样本。实验室检测确认，CLRDV目前在加利福尼亚州存在——标志着该州首次官方报告该病毒。
该团队的方法在很大程度上依赖于重新分析公共基因数据库中的现有数据。研究人员通过挖掘这些数据集，发现了与当前美国毒株密切匹配的病毒序列，提供了关于CLRDV在时间和地理上的传播的更完整的图景。这项研究强调了维护易于访问的公共数据库，以提高未来疾病监测和准备的重要性。
在一个意想不到的转折中，研究人员还在一个不寻常的位置发现了病毒的痕迹：来自加利福尼亚州一头牛肠道的样本。数据与假说一致，即这头牛摄入了受到CLRDV感染的植物性动物饲料。尽管这并不意味着动物会被感染，但为理解在官方首次报告之前，美国CLRDV感染的时间表和程度增添了一个新维度。
该研究还重新点燃了人们对棉花病理学中一个未解决问题的兴趣：铜枯病。研究人员提出CLRDV与铜枯病症状之间可能存在联系，这是一个过去引发争论的话题。“现在，随着越来越多的研究与我们的发现一致，这一观点正在获得关注，”奥尔梅多-维拉尔德说。“这可能有助于解释长期存在的作物损失，并为未来的病毒监测策略提供信息。”
农业研究服务局的科学家米歇尔·赫克（Michelle Heck）博士解释说：“对于种植者来说，这些发现既是一种警示，也是一种行动的呼吁。CLRDV在美国田野中存在的时间远比任何人意识到的要长，且可能比当前报告所暗示的更为广泛。了解该病毒为何在如此长时间内保持在雷达下——以及为何现在变得更加成问题——对制定有效的管理策略至关重要。”
该研究突出了生物信息学、植物病理学和跨学科合作在现代农业中日益增长的作用——并表明现有数据可能已经包含帮助我们更早检测新兴威胁的线索。
