欧洲参考基因组图谱（ERGA）试点项目庆祝其在汇聚来自欧洲各地的研究人员，共同开发98个物种的高水平参考基因组方面取得的成就。这一成就为创建一个涵盖所有欧洲植物、动物和真菌的综合参考基因组数据库迈出了关键一步。欧洲参考基因组图谱（ERGA）试点项目庆祝其在团结欧洲研究人员方面取得的成功，以创建98种不同物种的高质量参考基因组。这是在建立一个覆盖所有欧洲动物、植物和真菌的全面参考基因组数据库方面的重要进展。该项目于2021年由时任ERGA主席、来自莱布尼茨动物与野生动物研究所（Leibniz-IZW）的卡米拉·马佐尼博士发起，这一合作倡议得到了来自社区的广泛贡献。该项目的成功为建立一个新的、包容性和公平的生物多样性基因组学方法奠定了基础，具体细节在今天发表的《npj Biodiversity》期刊上的一篇研究文章中阐述。
在近期的出版物中，欧洲参考基因组图谱（ERGA）突出了其试点工作的成功成果。这个创新项目促进了一个跨越33个国家的科学家和机构的广泛合作网络，旨在至今为98种欧洲物种生产高质量的参考基因组。试点项目提供了重要的见解，暴露了关键的挑战，使得ERGA成为全球去中心化和包容性生物多样性基因组学倡议的领先范例。
该项目的重要里程碑包括来自希腊的物种的首个染色体级基因组组装，该地区被认可为欧洲的生物多样性热点。希腊的当地科学家收集了来自克里特壁蜥蜴（Podarcis cretensis）和亚里士多德鲶鱼（Silurus aristotelis）等物种的样本，创建的基因组现已在全球范围内免费获取。这些例子展示了全球生物多样性专家社区合作时所能取得的显著成就，增强了国内外的团队合作。ERGA试点项目优先考虑公平和包容，以确保基因组研究和资源可以被所有人，无论其位置，所获取。对于许多参与的科学家和国家而言，该项目是他们首次有机会为他们本地生物多样性的高级基因组资源的创建做出贡献。
此外，ERGA试点项目在引发欧洲及其他地区对生物多样性基因组学重要性的关注和认识方面也取得了成功。基因组数据可以提供重要见解，以指导威胁物种的保护策略，并推动人类健康、生物经济、生物安全及其他领域的进步。例如，北大西洋的一种重要鱼类——阿根廷大鱼（Argentina silus）在本项目中进行了测序。由此产生的参考基因组将增强科学家准确评估这一物种种群的遗传健康状况的能力，指导负责任和可持续的捕捞实践。
此外，白尾鹰（Haliaeetus albicilla）的高质量参考基因组第一次可供访问。这个新资源将促进对与已知症状相关的遗传疾病的研究。值得注意的是，它将有助于研究像“挤压综合症”这样的疾病，莱布尼茨-IZW的猛禽专家奥利弗·克罗内博士解释道。在这种疾病中，幼年白尾鹰的飞羽畸形，阻碍它们的飞行能力。导致这些羽毛畸形的遗传因素是由双亲鸟类隐性遗传的。鹰的基因组也为系统发育研究提供了机会，使得能够区分亚种群或识别隔离群体，克罗内指出。
随着全球科学界追求基因组数据的全部潜力，在ERGA下建立一个全欧盟的合作网络，加速了科学进展，并将其转化为对生物多样性和社会的具体利益。这个网络还帮助不同职业阶段的科学家发现培训、伙伴关系和资金的机会。ERGA试点项目由时任主席卡米拉·马佐尼博士和柏林生物多样性研究基因组中心（BeGenDiv）于2021年初共同发起，吸引了数百名基因组科学家参与，以包容和去中心化的方式设计和实施项目。
ERGA代表了更广泛的地球生物基因组计划（EBP）的欧洲节点，该计划旨在测序地球上所有的真核生物。实现这一雄心勃勃的目标需要全球参与和新的去中心化基因组生产方法。ERGA试点项目已经证明，完全合作和协调的基因组生产模式不仅是可实现的，而且是有效的——即使在没有集中资金的情况下也能在大陆级别上运作。事实上，该项目的预算大部分来自个别成员和合作组织的草根贡献，此外，还得到了测序合作伙伴和提供资助、折扣以及实物支持的商业测序公司的支持。
ERGA试点项目还识别和解决了与国际合作相关的各种挑战。这些障碍包括与跨境运输生物样本相关的法律和后勤问题、参与国家之间的资源不平衡，以及在确保仅生成符合EBP标准的最高质量参考基因组组装所需的标准化与去中心化之间的平衡。
ERGA的去中心化模式为生物多样性基因组学的未来带来了巨大的潜力。试点项目在建立动力和团结研究人员方面取得的成就展现了这一方法的有效性。通过促进国际合作和强调包容性与公平性，ERGA正在生物多样性基因组学领域建立新的标杆。在试点过程中获得的见解和解决的问题将为未来的举措提供指导，推进强大的标准化协议和覆盖整个欧洲及更广泛地区的全面基因组数据库。
欲了解更多信息
https://www.erga-biodiversity.eu/
https://begendiv.de/
