一个团队开发了一种新方法，通过在鸡蛋中培养年轻癌症患者的肿瘤并分析其蛋白质，快速找到个性化的治疗方案。该团队结合这两种技术，及时为年轻患者的肿瘤识别和测试出一种药物，以便用于治疗。他们在为患者找到新药物方面的成功表明，研究蛋白质（称为蛋白质组学）可以成为实时癌症治疗中与基因研究（基因组学）相辅相成的有价值补充。
一个泛加拿大全队开发了一种新方法，通过在鸡蛋中培养年轻癌症患者的肿瘤并分析其蛋白质，快速找到个性化的治疗方案。
该团队由不列颠哥伦比亚大学和BC儿童医院研究所的研究人员领导，是加拿大首个结合这两种技术以识别和测试年轻患者肿瘤药物的团队，以便及时用于治疗。
他们在为患者找到新药物的成功，今天在EMBO Molecular Medicine中描述，表明研究蛋白质（称为蛋白质组学）可以成为实时癌症治疗中与基因研究（基因组学）相辅相成的有价值补充。
这项工作是PROFYLE（为年轻人提供精准肿瘤治疗）的合作努力，这是加拿大儿童癌症网络ACCESS（推动儿童癌症体验、科学与生存）的关键倡议，汇集了来自加拿大的30多个研究和资助机构及超过100名研究人员，旨在改善儿童和年轻成年人癌症的结果。
共同首席作者Dr. Georgina Barnabas（Dr. Philipp Lange实验室的博士后研究员）和Tariq Bhat（Dr. James Lim实验室的博士生）所做的研究，集中在一位被诊断为罕见儿科癌症的无名患者身上，该癌症对传统治疗无效。
蛋白质组学：识别治疗的补充方法
尽管基因携带制造蛋白质的指令，但蛋白质本身是我们细胞的功能性构建块。大多数药物通过改变蛋白质的活性来发挥作用，因此团队想知道蛋白质组学是否能发现肿瘤中的隐藏弱点，而单纯的基因检测可能忽视这些。
在标准化疗失败后，肿瘤对基因组学选定药物产生耐药性，进一步的基因检测没有明确的药物候选者。然而，团队没有止步于此，而是转向蛋白质组学，发现肿瘤的代谢严重依赖于一种称为SHMT2的酶。
“仅靠基因组学，我们无法找到明确的治疗选择，”Dr. Lange表示，他与Dr. Lim和临床医生Dr. Rebecca Deyell一起，都是BC儿童医院癌症研究计划的高级研究员。“但通过观察肿瘤的蛋白质，我们发现了一个可以通过已有批准药物靶向的关键代谢弱点。”
研究人员的策略是使用舍曲林（一种常见的抗抑郁药）来抑制SHMT2，切断肿瘤对关键能源的获取。
在鸡蛋上复制肿瘤
为了测试他们的想法，团队使用一种方法，涉及在鸡蛋上培养患者肿瘤的一小部分，作为肿瘤的替代宿主。在患者体外培养相同的肿瘤，使他们能够在几周内测试个性化的药物反应。
“这种技术加快了评估治疗选择的过程，而以传统方法是根本不可能做到的，”Dr. Lim说。“我们能够快速确认通过蛋白质组学识别的药物是否真的能对患者的肿瘤有效。”
这些鸡蛋替代品是BC儿童医院BRAvE（通过替代品和证据获得更好的反应）倡议的一部分，该倡议将诊所与医院的研究实验室连接起来。
该团队向PROFYLE设立的专家小组展示了他们的结果，该小组认为截至当时舍曲林是患者的最佳治疗选择。
令人鼓舞的结果，但仍需进一步工作
结果令人鼓舞，但并不是治愈。开始舍曲林治疗后，患者的肿瘤生长减缓但并未停止，这意味着仍需额外治疗。
“虽然还有更多工作要做，但这项研究表明我们的方案可以快速提供个性化的治疗建议，实际上有助于罕见且难治的癌症患者，”Dr. Lange表示。“我们现在希望将这种方法扩展到更多儿童，以便在全国范围内更快地识别有效的治疗方案。”
