圣犹达发现了156个潜在的CAR T细胞免疫治疗靶点，旨在通过特异性地靶向癌细胞来改善癌症治疗。这种疗法涉及对患者的免疫细胞进行重组，使其攻击癌细胞。然而，寻找有效的固体肿瘤和脑肿瘤靶点一直是一个挑战。通过对数据的深入分析和体内实验验证，圣犹达的科学家们识别出这些潜在的靶点，为改善癌症疗法带来了希望。结果今天在《自然通讯》上发布。
“我们发现了癌症免疫治疗的靶点，希望未来能用于开发有效的治疗方案，”共同通信作者斯蒂芬·戈特沙尔博士说，他是圣犹达骨髓移植与细胞治疗部门的主席。“我们已经识别出该领域的大量潜在靶点，并确认了至少一个靶点，COL11A1。”
尽管COL11A1是研究人员在小鼠模型中测试的156个靶点之一，但其他靶点在细胞系中显示出潜力，例如抗纤维连接蛋白CAR T细胞。大多数靶点在癌症生物学和免疫学中具有重要意义。“我们希望通过分享这些数据资源，能够加速儿童癌症新治疗靶点的发现，”张教授说。
研究人员计划定期更新数据库，增加新的发现，并扩展分析的儿童癌症类型。他们还鼓励与其他研究者合作，进一步推进对儿童癌症的理解并开发有效的治疗方案。“我们发现的数据，”戈特沙尔解释道，“使其他科学家能够确定特定靶点是否存在于某种特定类型的儿科癌症中。他们可以在云端访问这些信息并进行自己的分析。”研究人员通过对基因外显子的全面分析识别了COL11A1和其他靶点。当一个基因转录为RNA时，仅保留外显子区域以创建成熟的产物，这为蛋白质翻译提供了模板。团队从1,532个儿科肿瘤样本和7,460个正常样本中检查了整个转录组测序数据。圣犹达识别癌症特异性外显子的方式涉及找到在癌细胞中比在正常细胞中更具选择性或唯一表达的外显子。这些特定的外显子可以成为CAR T细胞的潜在靶点，而不会对健康细胞造成伤害。最终的靶点列表还包括在之前分析中识别出的几个靶点，目前正处于临床研究中，这增强了该团队分析方法的信心。
这种方法与以往的CAR靶点搜索在多个方面有所不同。样本量更大，研究涉及所有主要癌症类型，导致候选池更大。研究人员通过关注膜内和细胞外基质中的蛋白质，扩大了他们对CAR T靶点相关候选者的搜索，这是一种非常规的方法。通常，寻找新CAR靶点的团队只查看膜相关蛋白，但他们的一个靶点建议扩大标准，包括细胞外基质蛋白。这些蛋白质并不锚定在细胞上，而是粘附在细胞表面，仍然可以被CAR识别。科学家们发现某些基因通过产生特定蛋白在癌症发展中发挥作用。他们还发现这些基因有不同的部分产生不同版本的蛋白，被称为同种型。这类似于电影的导演剪辑版，场景有所改变，但仍保留原作的核心相似性。癌细胞倾向于创造这些同种型，这在圣犹达的分析中采用了比以往方法更可靠的方法。“我们测试了基因中的一个子集或所有外显子在癌细胞与正常细胞之间是否显示出差异，从而使我们能够评估同种型和基因水平的癌症特异性。”
