不同的方法在一项关于乳腺癌转移的详细研究中进行了比较,为肿瘤科学提供了新的见解。
不同的方法在一项关于乳腺癌转移的详细研究中进行了比较,为肿瘤科学提供了新的见解。
转移性乳腺癌 (MBC) 是全球女性癌症相关死亡的最常见原因。尽管癌症治疗和前沿治疗策略取得了显著进展,一些恶性肿瘤仍然是不可逆转的。这种情况的一个因素是癌症的复杂多样性。在一定程度上,科学困难限制了科学家们对此范围的科学研究。现在来自达纳-法伯癌症研究所、麻省理工学院和哈佛大学的布罗德研究所的全球医生-科学家和研究人员,包括Johanna Klughammer、Daniel Abravanel、Aviv Regev和全面调查的共同负责人Nikhil Wagle,已经采用多种方法来检查恶性细胞的多样性及其与移动环境的相互作用。研究结果为未来研究提供了关于侵袭性乳腺癌生理的重要信息。
研究人员分析了来自人类肿瘤图谱网络 (HTAN) 的60个乳腺癌转移样本中67个活检的所有RNA分子的总和。这些“脐纹”中哪些染色体在特定时刻有效?专家们使用了两种不同的方法,一种用于测量细胞的整个微生物组,另一种则仅用于测量体内原子。然而,这些技术导致了细胞在空间上组织情况的细节丧失。研究人员使用多达四种不同的空间分辨方法来分析丰富的组织区域,并为15个样本创建空间外观特征,以获取这些数据。
综合数据库
通过这些广泛的数据,我们能够比较不同的方法,找到相似之处和差异。我们的发现可以帮助未来的研究人员选择最合适的方法来解决他们的研究问题,Klughammer,这项数学分析的首席研究员说。该团队的肿瘤范围从不同的临床相关亚组到身体的九个不同区域,包括大脑、心脏和脊椎。尽管宽广的视角在某种程度上限制了对个人变量的分析能力,但我们发现关于恶性细胞科学的引人入胜的线索,Klughammer说。这包括关于肿瘤的身体类型、在这些组织中如何激活特定染色体以及细胞的地理组织如何的信息。
例如,让分析师感到惊讶的一件事是,一个人的体内恶性细胞表现出非常强的外观信息。根据Klughammer的说法,我们查看了几种不同的活检样本,并发现某些人的表现型曲线非常相似,即使肿瘤出现在不同的身体部位,或者样本的采集相隔多达200次。相反,研究人员发现患者之间存在巨大差异。
细胞特征描述
研究人员还发现不同恶性表达表型与临床特征之间的联系:大多数恶性细胞表现出典型的上皮细胞特征。然而,在一些样本中,研究人员观察到与干细胞、神经元或软骨相关的基因表达。有趣的是,表现出干细胞样行为的样本来自于一位在该组中生存时间最短的患者,尽管早期诊断并接受了适当的治疗。唯一表现出“软骨样”行为的样本是肿瘤组织学典型的、罕见且通常难以治疗的乳腺癌的一种。
癌细胞、宿主组织的自然细胞和具有与癌细胞作斗争潜力的迁移免疫细胞构成了转移的大部分。Klughammer说:“一个令人兴奋的发现是,肿瘤细胞的表达特征取决于它们是否在附近有免疫细胞(也称为T细胞或NK细胞)。”例如,研究人员发现,似乎将T/NK细胞保持在其邻近环境之外的肿瘤细胞更有可能表达SOX4基因,而来自同一活检与T/NK细胞存在的肿瘤细胞则不然。这进一步证明,肿瘤水平的局部环境也会经历免疫逃逸机制。
“总体而言,我们的研究为转移性乳腺癌的生物学提供了新的见解,显示了空间表达特征的潜力,”Klughammer解释道。我们的发现可能会在长期内导致对患者更加细致的分类和更具针对性的治疗策略。