了解病毒在宿主群体中传播的速度对于有效管理疾病暴发至关重要。比利时布鲁塞尔大学（ULB）的西蒙·德利库尔及其团队于12月3日在《PLOS生物学》上发表的一项最新研究，评估了跟踪病毒在感染群体中随时间和空间移动的统计措施的有效性。
通过使用基因组测序，流行病学家可以调查疾病暴发的进化背景并监测其地理传播。然而，基因组数据的采样强度可能影响关于病毒如何扩散的见解的可靠性。为了探索采样规模如何影响这些见解，研究人员模拟了不同病原体的传播，并评估了从病毒基因组分析中得出的三个指标：谱系扩散速度（谱系推进的速度）、扩散系数（向新区域侵入的速度）和距离隔离信号（随着距离增加，群体的基因组序列失去相似性的程度）。
研究结果表明，扩散系数和距离隔离信号这两个指标受到采样规模和强度的影响最小。当将这些指标应用于比较各种病毒在动物群体中的扩散时，很明显，病毒传播的速度和距离与感染宿主动物的扩散能力相关，尽管如动物贸易等人类活动也可能产生影响。然而，研究也存在其局限性；特别是，由于时间和资源的限制，模拟框架没有包括实际基因组序列的生成。
作者声明：“总之，我们的研究为未来研究中利用谱系扩散指标提供了重要建议，并展示了它们在比较不同背景下病毒传播中的有效性。”
他们进一步解释道：“这项研究评估了进化树中的各种指标，以量化病毒在自然环境中的扩散方式。通过应用最有效的指标，我们可以比较动物群体中不同病毒的扩散模式，突显出广泛的扩散速度，这通常反映了主要感染宿主物种的扩散能力，同时也指示了与动物贸易等人类活动相关的显著和/或远距离扩散的案例。”
