研究人员发现,BCR::ABL1数字PCR的临床应用可以可靠地量化慢性髓性白血病(CML)的稳定深分子缓解,这将有助于确定哪些患者可以潜在中断慢性药物治疗。对于检测残留白血病疾病的超低水平,针对CML的这一独特转录本比当前的标准实时定量PCR(RT-qPCR)更敏感和准确。结果在由爱思唯尔出版的《分子诊断杂志》中的一项新研究中报告。
首席研究员彼得·E·韦斯特维尔医学博士、医学博士、阿尔伯特·施韦泽医院内科,荷兰多德雷赫特表示:“在我们的研究中,我们显示BCR::ABL的数字PCR在几乎所有(97%)深度分子缓解患者的样本中达到了足够高的灵敏度。在标准RT-qPCR技术的检测限以下的患者中,有三分之二能够检测到分子目标。因此,数字PCR更敏感和更准确,能够可靠地测量以选择适合药物治疗中断的深度缓解CML患者。”
BCR::ABL1是CML特征性的特定基因融合蛋白,当两个基因BCR和ABL1异常结合在一起时形成。通过使用酪氨酸激酶抑制剂(TKIs)的靶向治疗,CML患者可能会实现深度分子响应。达到这种缓解程度的患者可以拥有正常的预期寿命,并可能有资格尝试中断TKI治疗。
在一项全国性的前瞻性多中心研究中,研究人员从考虑进行TKI中断尝试的荷兰CML患者那里收集了样本。从2020年7月起,来自31个医疗中心的136名CML患者共168个样本在2023年5月的分析时收集完成。
关于研究结果,韦斯特维尔博士表示:“BCR::ABL1数字PCR被发现能够准确量化BCR::ABL1在国际标准上约为0.0023%的水平,这是在无治疗缓解的背景下临床相关的预测临界值。目标灵敏度设定在MR5.0,要求在至少100,000个常规拷贝背景中可靠地检测到一个转录本。这在97%的评估中实现。数字PCR能够在当前标准RT-qPCR检测限以下的68%样本中检测和量化BCR::ABL构造。”
此外,研究人员注意到,患者在数字PCR技术生成的液滴荧光水平之间存在差异。这是由于个别患者携带的转录本类型不同。高荧光液滴含有目标转录本类型,被视为阳性,而低荧光液滴则被视为阴性。
韦斯特维尔博士解释道:“一些患者有所谓的e13a2转录本类型,而其他患者则有e14a2转录本类型。我们验证了该检测能够用于识别有可检测疾病的患者的转录本类型。这一额外发现非常重要,因为我们之前已经表明转录本类型是药物中断后分子复发的风险因素。通常,患者的转录本类型未知,并且一旦患者处于深度缓解状态,不能通过标准技术确定。”
本研究中的BCR::ABL数字PCR使用了FDA批准的商业化检测,这使得其普遍使用成为可能。这项技术可能通过使对微小残留疾病的监测更加精确以及更好地评估考虑无治疗缓解的患者风险,从而改善CML的管理。
韦斯特维尔博士总结道:“BCR::ABL数字PCR是一种有价值和可靠的工具,可协助CML的临床决策。”