头颈癌研究人员报告了HPV-DeepSeek的开发和测试，这是一种新型液体活检检测。在他们的新研究中，HPV-DeepSeek在诊断与HPV相关的头颈癌方面达到了99%的敏感性和特异性，优于标准护理方法。HPV导致美国约70%的口咽癌，这些癌症的发生率增长速度快于其他头颈癌。
根据新的麻省总医院布莱根研究，新的液体活检血液测试可以帮助以显著更高的准确性检测与人乳头瘤病毒（HPV）相关的头颈癌病例，包括在患者出现症状之前。
位于麻省总医院布莱根医疗系统的麻省眼耳研究人员发现，他们开发的基于血液的诊断测试HPV-DeepSeek在第一次临床表现时诊断癌症时达到了99%的敏感性和99%的特异性，包括病程的最早阶段。这种更高的准确性显著优于目前的标准护理方法，包括其他市售的液体活检检测。该研究发表在《临床癌症研究》杂志，这是美国癌症研究协会的一本期刊。
HPV导致美国约70%的口咽癌，这些癌症的发生率增长速度快于所有其他头颈癌，然而，与同样由HPV引起的宫颈癌不同，目前没有早期检测测试。这意味着患者通常在出现症状后才向医生就诊，这需要可能伴随显著副作用的治疗，根据该研究的首席作者丹尼尔·法登博士的说法，他是迈克·托斯头颈癌研究中心的首席研究员及麻省眼耳的外科肿瘤学家。
法登说：“开发HPV-DeepSeek的目标是创建一种对HPV癌症的检测方法，具有显著高于目前可用方法的敏感性。我们的发现表明，我们可以利用这种方法不仅更准确地诊断患者，同时也具备在患者尚未出现症状之前通过血液筛查HPV癌症的潜力，使我们能够在最早阶段捕捉并治疗他们的癌症。”
HPV-DeepSeek检测已从肿瘤中断裂并进入血液的病毒基因组片段，以及血液中的其他九个特征。与当前液体活检方法仅针对一到两个病毒基因组片段不同，HPV-DeepSeek使用整个HPV基因组的全基因组测序。在新的研究中，研究人员在152例HPV相关头颈癌患者和152名健康对照者中测试了HPV-DeepSeek。他们还与目前的液体和组织活检方法进行了面对面的比较。他们发现这种新方法显著提高了敏感性和准确性。
研究人员正在进行关于HPV-DeepSeek的进一步研究，包括其在肿瘤发展前多年筛查癌症中的作用。在一项当前处于预印本阶段的研究中，他们在28名多年后发展为HPV相关口咽癌的人和28名健康对照者中测试了该检测。他们发现可以在79%的后来发展为癌症的个体中检测到癌症，而所有对照者的测试结果为阴性。最早的阳性结果出现在诊断前近八年，这首次表明高准确度的血液筛查HPV癌症是可行的。这项工作也在2024年研讨会《AACR癌症研究特别会议：液体活检：从发现到临床实施》中进行了展示。
法登表示：“这些癌症的自然历史是它们在大约15年的时间内生长，并随着生长释放HPV基因组中的DNA进入血液。如果我们能在它们的最早阶段几年前就检测到这些癌症，这将极大改变我们对患者的治疗；例如，能够使用更少的治疗以减少副作用。”法登补充道：“虽然我们的结果表明临床收益的巨大潜力，但仍然存在未解答的问题，我们需要解决以了解如何最好地利用这些方法，以及对那些筛查出阳性结果的患者的后续方案。”
该团队现在正在进行研究以解决这些问题，涉及与HPV相关的头颈癌及其他HPV癌症。除了筛查，该团队还在进行临床试验，研究在手术后检测残余微小疾病的有效性，这可能会告知是否需要额外的治疗，例如放射治疗。
使用液体活检进行癌症早期检测和手术后个性化治疗是其他类型头颈癌研究日益增长的领域。在同一期的《临床癌症研究》上，法登及其团队在未由HPV引起的头颈癌患者中测试了另一种新型检测MAESTRO，以寻找手术后残余癌症的证据。此方法在麻省理工学院和哈佛大学的布罗德研究所开发，通过使用一种专门的方法以最小测序检测全基因组肿瘤DNA，从而提高了敏感性。他们发现该检测能够在手术后的几天内准确检测到一种高度侵袭性的头颈癌中的残余癌症，且通过该检测发现有残余疾病的患者的生存与复发结果显著较差。
麻省理工学院布罗德研究所癌症诊断中心的主任维克托·阿达尔斯坦森博士表示：“人们一直想知道更敏感的液体活检测试是否会开始检测到不会导致复发的残余癌症。”他所在的团队开发了MAESTRO。“在这项研究中，MAESTRO不仅在更多出现未来复发或死亡的患者中检测到残余癌症，而且对于复发也具有很高的预测性。”
法登表示：“如HPV-DeepSeek和MEASTRO等全基因组测序的液体活检方法极其强大，允许医生寻找成百上千根针在干草堆中，而不仅仅是少数几根，从而显著提高了敏感性。”他补充道：“对患者而言，这意味着显著更准确的结果，距离真正的个性化护理又近了一步。”
