加州大学圣克鲁兹分校的研究人员发现了一种在人类RNA中控制炎症的肽,这可能为治疗关节炎和狼疮等疾病提供一种新的方法。他们利用CRISPR基因编辑工具的筛选方法揭示了有关RNA的一个重大谜团,RNA负责将遗传信息从DNA中转移。研究利用CRISPR基因编辑工具深入研究RNA,这一分子负责实现来自DNA的遗传指令。研究的重点是一个名为LOUP的长非编码RNA(lncRNA)衍生的肽。人类基因组中包含超过20,000个lncRNA,使其成为基因组中产生的最大基因群体。尽管数量庞大,但对lncRNA存在原因或其功能的理解有限,因此lncRNA被称为“基因组的暗物质”。该研究于5月23日发表在《美国国家科学院院刊》上。美国国家科学院院刊(PNAS)是为数不多深入研究lncRNA奥秘的来源之一。该研究还介绍了一种新的方法,通过高通量筛选快速识别免疫细胞中的功能性lncRNA。这一方法使研究人员能够在一次实验中靶向数千个基因,与传统一次关注一个基因的实验相比,更高效地研究基因组中未特征化的部分。研究由加州大学圣克鲁兹分校分子、细胞与发育生物学系的免疫学家苏珊·卡彭特教授领导。来自发育生物学系的科学家史密斯博士正在研究保护免受感染的分子机制。她的主要研究重点是理解lncRNA在导致炎症过程中的作用,因为炎症是许多疾病的一个关键特征。史密斯博士的实验室特别试图识别调节炎症的lncRNA基因。为此,他们正在研究一种称为单核细胞的白血球中的lncRNA。他们使用CRISPR/Cas9技术的修改版本,称为CRISPR抑制(CRISPRi),来抑制基因转录并识别所涉及的lncRNA基因。通过识别与单核细胞向巨噬细胞分化相关的lncRNA,研究人员使用CRISPRi筛选巨噬细胞中的lncRNA以其在炎症中的作用。令人惊讶的是,发现了一个多功能区域,含有一种未被发现的肽,该肽调节炎症并且具有RNA的功能。这种对肽在调节炎症中的作用的新理解为药物开发者提供了一个靶点,以抑制导致炎症反应的分子相互作用。她说:“在一个理想的世界中,目标是创造一种小分子,可以扰乱这种特定的相互作用,而不是靶向可能存在于全身的蛋白质。我们离能够以这种精确度靶向这些途径还有很远,但这确实是我们的目标。目前RNA治疗方法引起了很多关注。”加州大学圣克鲁兹分校研究的合著者包括海莉·哈拉兹、埃里克·马勒科斯、塞尔吉奥·科瓦鲁比亚斯、萨米拉·伊提兹、克里斯蒂·蒙塔诺、莉莎·苏德克和索尔·卡茨曼,以及来自UCSF和MIT的研究人员。这项研究得到了美国国家医学科学研究所和美国国立过敏与传染病研究所的资助。