研究人员开发了一种新方法,从细菌数据集中识别潜在的抗微生物药物,为传统抗生素提供了替代解决方案的见解。
最近发表在eLife上的一项研究提出了一种新颖的策略,用于发现抗微生物溶菌素——在感染过程中由噬菌体产生的酶——具有治疗益处。该研究强调了两个有前途的溶菌素PHAb10和PHAb11的发现,并旨在为微生物学家提供有助于进一步研究的信息。
抗生素耐药性上升的威胁,即致病微生物进化以抵抗现有治疗,构成了一个重大全球健康挑战。各个领域抗微生物药物的滥用被确定为推动耐药性扩散的关键因素。
溶菌素源自感染细菌的噬菌体,提供抗微生物效果,并被认为是抗生素的可行替代品,因为它们抵抗性风险较低且具有独特的作用模式。第一作者李张,博士候选人,强调了溶菌素作为潜在感染治疗的重要性,尽管噬菌体基因组数据的可用性有限。
过去对溶菌素的研究将其抗微生物特性与内部肽相关联,这促使张及其团队探讨细菌蛋白质组数据集,以寻找具有抗微生物活性的新的溶菌素。通过利用细菌Acinetobacter baumannii的蛋白质组数据库,研究人员能够识别出五种新的溶菌素,尤其是PHAb7-11,其中PHAb10和PHAb11显示出最有希望的效果。
进一步的评估涉及合成溶菌素的基因编码序列,并测试其针对不同细菌种类的抗微生物功效,甚至在低浓度下也展示出强大的抗菌活性。
该研究还评估了PHAb10和PHAb11在各种条件下的抗菌表现,展现了在不同生长阶段对细菌的强大活性,包括对传统抗生素具有耐药性的细菌。此外,研究人员观察了PHAb10的热稳定性,阐明了其在热应激下的结构变化,这一特性对其潜在治疗用途至关重要。
团队的发现强调了利用大数据,包括细菌基因组和蛋白质组,在应对抗生素耐药性方面的潜力。通过利用筛选策略,研究人员在PHAb10和PHAb11中识别出了具有广谱抗微生物特性的高度热稳定溶菌素,值得进一步研究其治疗应用。
研究人员强调进行额外测试的重要性,例如活/死检测,以增强其发现的可信性,并更好地理解溶菌素对细菌的清除机制。
资深作者杨杭强调了日常更新的大数据在抗击抗生素耐药性中的重要性,并强调了团队在识别潜在治疗溶菌素方面的方法的重要性。如果在后续研究中得到验证,PHAb10和PHAb11可能成为治疗细菌感染的有前景候选者。