研究人员在常见的代谢物样本中发现了超过1000种以前未被识别的蛋白质，这些蛋白质在通过提取方法去除它们的尝试后仍然存在。这些结果为增强未来的代谢组学研究提供了新的视角和策略，包括在提取过程中消除这些蛋白质的独特程序。虽然这项研究并没有否定过去的发现，但强调了在实验设置和分析中进行适当对照和验证的必要性。
“科学进步往往源于偶然与细致观察的结合。在这种情况下，我们在实验中遇到了一个异常的结果，进一步调查后发现了这一大批逃避标准代谢物提取的蛋白质，”VAI质谱核心的主任、研究的主要作者瑞安·谢尔顿博士解释道。“这些蛋白质有可能掩盖结果并引入错误的结论。我们希望我们的发现能引起对这些隐藏蛋白质的关注，并加强代谢组学领域。”
传统观点认为，代谢物提取中使用的化学物质会消除样本中的任何蛋白质，防止它们影响最终的分析。然而，这项研究表明，某些蛋白质仍然存在，这可能会改变样本的预期特征并影响结果。
为了排除这些潜在的麻烦蛋白质，谢尔顿和他的团队在标准提取过程中加入了一个过滤步骤，去除大于3千道尔顿的蛋白质，涵盖大多数蛋白质。
“最终，即使使用最先进的仪器，样本准备问题也可能阻碍技术的有效性，”谢尔顿指出。“确保我们的样本不含任何干扰蛋白质对于获得精确结果至关重要。我们的发现有助于实现这一目标。”
这项研究由VAI质谱核心的研究科学家莫莉·霍普博士领导，前范安德尔研究所研究生院学生、目前在VAI的埃文·连博士指导下的癌症表观遗传学培训项目支持的博士后研究员瑞·豪斯博士共同参与。参与该研究的其他研究人员包括范安德尔研究所的迈克尔·P·文森特博士、艾米丽·沃尔弗鲁姆博士、克里斯廷·N·伊萨吉尔雷博士等。
