一项最近的研究发现，黑色素瘤患者的生存率与组织驻留记忆T细胞（TRM）数量的增多之间存在联系。这项研究的发现可以用于基于TRM创建黑色素瘤预后预测模型，并阐明TRM细胞在肿瘤免疫微环境中的作用。该信息可能有助于改善癌症患者的个性化抗肿瘤免疫疗法。
在特拉萨基生物医学创新研究所（TIBI）进行的一项广泛分析研究发现，黑色素瘤患者的生存结果与组织驻留记忆T细胞（TRM）的高数量有关。这项研究的数据可以用于基于TRM的黑色素瘤预后预测机器学习模型。它还可以帮助理解TRM细胞在肿瘤免疫微环境中的作用，这可以导致更个性化和有效的抗肿瘤免疫治疗方法。肿瘤微环境（TIME）涉及肿瘤细胞、免疫细胞及其他成分在肿瘤内部及周围之间的相互作用。TRM细胞是一种独特的免疫细胞类型，存在于周围组织和各种类型的癌症中。理解TRM细胞在TIME中的存在和功能，对于癌症免疫治疗和研究其对患者生存的影响至关重要。确定癌症患者TRM细胞的存在和数量至关重要，尽管以往的研究在黑色素瘤患者中产生了矛盾的结果。目前尚缺乏对TRM细胞丰度的全面评估和与患者生存结果相关的免疫组学数据分析的研究。
为了解决这一空白，TIBI团队利用单细胞RNA测序（scRNA-seq）数据，这是一项强大的技术，提供了大规模的个体细胞完整基因组特征。与依靠有限数量的细胞标识基因不同，scRNA-seq允许进行更全面的分析。A-seq技术为细胞类型和功能分类提供了更彻底和精确的方法。这使得能够生成代表特定免疫细胞类型的独特基因特征，并可能与疾病的存在相关联。
在最近发表在《iScience》上的一篇文章中，研究人员将这种方法应用于两组黑色素瘤患者的scRNA-seq数据，并识别出11种与患者中TRM丰度强相关的基因特征。他们还发现这些基因特征与患者生存结果之间存在显著联系。研究结果表明，TRM细胞丰度与黑色素瘤TIME中多种抗肿瘤免疫细胞的存在呈正相关。此外，TRM细胞与免疫通路和调节基因相关，表明其在免疫调节中的重要作用。TRM细胞的丰度与更活跃的黑色素瘤TIME和改善的患者生存结果相关。最后，研究人员能够利用数据开发出一种高精度的TRM衍生风险评分系统，对患者进行高风险或低风险的黑色素瘤预后分类。
TIBI的主任兼首席执行官Ali Khademhosseini解释说，与TRM细胞相关的科学方法和发现可以增强对癌症患者免疫治疗药物反应的评估。这可能导致对单个癌症患者治疗影响的更精确评估，最终改善患者的结果。
该研究的作者包括Chongming Jiang, Cheng-Chi Chao, Jianrong Li, Xin Ge, Aidan Shen, Vadim Jucaud, Chao Cheng和Xiling Shen。
资助信息：该研究着重于根据患者黑色素瘤预后的风险进行分类。该研究得到了美国国立卫生研究院（NIH）R01 DK119795和R35 GM122465的支持，以及德克萨斯州癌症预防研究所（CPRIT）(RR180061)的资助。
