新加坡A*STAR基因组研究所(GIS)和生物信息学研究所(BII)的一组科学家开发了一种名为“BANKSY”的新人工智能软件工具,能够识别组织中不同类型的细胞,如肌肉细胞、神经细胞和脂肪细胞。该工具不同于传统的基于相似分子的人工智能工具,还考虑到细胞在组织中的环境相似性。BANKSY是一种新的人工智能工具,它可以根据细胞的相似性将细胞分组,同时考虑细胞在组织中的环境相似性。这项先进的技术将帮助研究人员更好地理解各种疾病(如癌症和神经系统疾病)中的组织过程。BANKSY的使用可以支持更有效的诊断和治疗的发展,最终将推动该领域更快、更准确的进展。这项突破性技术的研究发表在文章《BANKSY统一细胞分类和组织域分割以实现可扩展性sp》中。
BANKSY于2024年2月27日在《自然遗传学》上发表了关于空间组学数据分析的研究。
BANKSY具有从组织样本的空间分子特征中识别细胞群微小差异的能力。此外,BANKSY还可以区分组织切片中功能上不同的解剖区域,例如人类前脑中的分层结构。
空间分子剖析(空间组学)技术是先进的显微镜,能够通过揭示单个生物分子的精确位置,使科学家详细检查组织。BANKSY旨在帮助生物学家分析细胞和组织的空间组织。这种理解对于准确的诊断和个性化患者治疗以及新药的开发至关重要。BANKSY能够解读和提取最新的空间组学技术中的见解,使其成为一个多功能、准确、快速且可扩展的工具。软件BANKSY擅长分析RNA和基于蛋白质的空间组学数据。它能够处理超过两百万个细胞的大型数据集,并被发现比竞争方法快10到1000倍。此外,BANKSY的可扩展性是其他方法的两到60倍,适合处理其他重要数据处理任务,如检测和去除样本中的低质量区域,以及结合来自不同患者的样本进行分析。
独立基准测试显示,BANKSY是空间组学数据中表现最佳的算法,两项独立研究得出结论,认为它可以成为数据分析的有价值工具。已经为领域识别开发了一种强大解决方案。在最近的一项研究中,测试了六种算法,最终判断BANKSY在数据分析中最为准确。
A*STAR的GIS高级组长Shyam Prabhakar博士表示期待BANKSY将革命化新兴空间组学技术的应用。希望这个工具能加深对各种疾病中的组织过程的理解,从而导致对癌症和神经系统疾病等情况的更有效治疗。
本篇文章讨论了BANKSY的开发,这是一项旨在识别促使肿瘤生长和扩散的细胞的新技术。ASTAR的GIS代理执行董事刘健俊教授强调了将高通量技术与人工智能软件结合以解决医疗问题的潜力。新加坡国家癌症中心的高级顾问Iain Tan博士强调使用BANKSY来针对促进肿瘤生长和扩散的细胞。