研究人员揭示了我们对T系急性淋巴细胞白血病（T-ALL）这一侵袭性且高风险癌症的理解发生了突破性的变化。这一新见解强调，许多与T-ALL相关的遗传变化通常发生在我们DNA的非编码部分。
儿童医院（CHOP）、圣犹达儿童研究医院（St. Jude）和儿童肿瘤组（COG）的一组科学家今天宣布了这一重要转变。他们的合作研究得到了加布里埃拉·米勒儿童优先研究计划（Kids First）和美国国立卫生研究院（NIH）共同基金的支持，研究结果发表在《自然》期刊上。
尽管许多年轻的T-ALL患者最初对治疗反应良好，但那些经历复发或患有耐药性形式疾病的患者往往面临严峻的结果。T-ALL的快速进展和侵袭性特征，以及对其遗传基础的有限了解，促使研究人员寻求新的改进的诊断和治疗策略。
据克林童年癌症研究中心主任兼COG急性淋巴细胞白血病委员会主席大卫·T·蒂奇博士表示：“这项研究标志着一个突破性的进展，因为它全面分析了整个基因组，揭示了来自1300多名被诊断为T-ALL的儿童、青少年和年轻成人的重要见解。我们的发现极大地推动了临床实践；治疗T-ALL的目的是预防复发，有效识别出高风险患者。”这些数据使我们能够根据患者复发的风险对其进行分类，从而使治疗能够使用更新或替代的疗法。
早期的研究在识别T-ALL中重要的遗传改变方面未能成功，因为它们主要集中在编码区域，而这些部分编码细胞构成所必需的蛋白质。值得注意的是，仅约1%的DNA是编码部分，而其余99%被称为非编码DNA。
曾被视为无关的非编码区域现在被理解为调节许多生物过程的关键。它们的作用类似于交通引导，指引细胞何时产生特定的蛋白质。
在他们的研究中，研究人员分析了在COG AALL0434临床试验中注册的1300多名患者，分析了每位参与者的肿瘤和非肿瘤基因组。尽管之前的研究建议非编码DNA在T-ALL中可能具有影响，但这项研究是第一次在如此大规模上确认这一点。
研究人员发现，约60%的导致T-ALL的遗传变化来源于非编码区域。这一发现从根本上改变了对T-ALL的看法，提供了对其生物成分更深入的理解，并为创新疗法打开了大门，包括CHOP和圣犹达正在开发的新免疫疗法。
过去，T-ALL患者的风险分类是基于他们的治疗反应和免疫表型，这一表型通过分析细胞表面蛋白质进行诊断。尽管这种方法有助于T-ALL亚型的分类，但并未始终清楚地确定哪些患者可能有良好的预后。新获得的全面数据解释了原因，倡导采用基因组方法取代传统的免疫表型分类。因此，研究人员创建了能够基于遗传数据和治疗反应准确分类T-ALL患者的模型，并且他们当前正在使用即将进行的COG T-ALL试验的样本来验证这些模型。
来自圣犹达儿童研究医院的查尔斯·穆利根博士指出：“看到非编码变化的普遍性以及增强子破坏事件的程度，无论是通过劫持或修改现有增强子，还是创建新的增强子，都是令人惊讶的。凭借这种增强的理解，我们可以改进我们的实验室工作，专注于这些相关的改变，以开发合适的诊断测试。”
该研究已根据其独特的基因表达和基因组驱动因素将T-ALL划分为15个不同的亚型，包括先前未被识别的类型。研究还改善了我们对已知亚型的理解，并展示了驱动突变以及其他遗传改变和初始细胞类型如何共同作用以定义基因组亚型及其临床和生物特征。一个重要的发现将特定类型的基因适应与T-ALL的预后和治疗结果联系起来，表明改变哪些基因以及这些改变的性质对诊断都很重要。
蒂奇博士强调：“未来的研究必须在这一方法上进一步扩展。这些结果为改善患者结果和努力治愈更多受到T-ALL影响的儿童和成人提供了坚实的基础。”
